Các vi khuẩn kháng thuốc có cơ chế kiểm soát gien có thể trục xuất hoặc tiêu hủy kháng sinh, tuy nhiên, các vi khuẩn dung nạp thuốc đơn giản có thể đi vào trạng thái bất hoạt hoặc phát triển chậm lại để tồn tại khi kháng sinh khuếch tán. Nghiên cứu của Đại học Hebrew Jeerusalem, công bố trên Science Escheriachia coli tiếp xúc với ampicillin qua nhiều thế hệ có thể trở nên kháng thuốc do đột biến gien ampC. Đạt được trạng thái dung nạp phải trải qua nhiều bước, tuy nhiên, bước đột biến đầu tiên làm chậm quá trình tăng trưởng, sau đó là quá trình đột biến ampC kháng amipicillin. GS Kim Lewis, Đại học Northeastern, người không liên quan tới nhóm nghiên cứu này, cho rằng “nhiều người, bao gồm cả tôi, đã tranh cải rất nhiều rằng quá trình dung nạp làm cho các tác nhân gây bệnh tồn tại và đấu tranh để được sống thêm một ngày, nhưng nghiên cứu này cho thấy khi đột biến kháng thuốc xảy ra dưới dạng dung nạp, vi khuẩn sống sót tốt hơn”